Wspólnota św. Józefa powstała w czerwcu 1999 r. z inicjatywy o. Błażeja Sekuły, który prowadził spotkania modlitewne. Początkowo grupa była nieliczna, lecz w obecnym czasie liczy około 40 osób. Z biegiem czasu z nieformalnej grupy modlitewnej stała się wspólnotą Odnowy w Duchu Świętym, którą charakteryzuje charyzmatyczna modlitwa spontaniczna.Od listopada 2002 r. liderem wspólnoty była Honorata Ławrynowicz, a obecnie jest Andrzej Barełkowski. Natomiast o. Błażej pełni funkcję pasterza wspólnoty. Drugim duszpasterzem jest o. Arnold Liebig. Od ponad roku spotkania modlitewne są uświetnione pieśniami religijnymi, granymi przez grupę muzyczną, którą prowadzi Andrzej Barełkowski. W ramach wspólnoty od listopada 2003 r. funkcjonują 4 diakonie, czyli małe grupy dzielenia i służby: diakonia gościnności i troski (animator: Grażyna Strapagiel), diakonia osłony modlitewnej (animator: Wanda Przybyła), diakonia służby chorym (animator: Małgorzata Twardowska) i diakonia ewangelizacji (animator: Andrzej Barełkowski). W ramach wspólnoty istnieje również grupa modlitwy wstawienniczej, która służy modlitwą osobom potrzebującym wsparcia duchowego i mocy Bożej. Zapraszamy na spotkania modlitewne w każdą środę po Mszy Świętej wieczornej w klasztorze, czyli około godz. 18:45, odbywające się w Domu Serca. Ponadto w gablotach przy klasztorze Franciszkanów są wywieszone aktualne informacje dotyczące życia wspólnoty. Wspólnota św. Józefa prowadzi w klasztorze coroczne czuwania w soboty przed trzema uroczystościami: Świętem Miłosierdzia Bożego (kwiecień), Świętem Zesłania Ducha Świętego (maj/czerwiec) i Świętem Podwyższenia Krzyża (wrzesień). Czuwania zaczynają się zwykle około godz. 20:00, na które również chętnych gorąco zapraszamy.